临床科室：感染科、肝病科、结核病科、皮肤性病科、职业病科、中医科、艾滋病科、消化科、呼吸科、妇产科、外科、急诊科、重症医学科、内分泌科、介入科、康复科、营养科
省级临床重点专科：肝病科、结核病科
省级临床重点专科建设单位：职业病科
市级医学重点学科：传染病学、结核病学、检验医学、肝病学、职业病学
市级临床重点专科：肝炎专科、结核病科、艾滋病科、职业病科、检验科、感染急诊科、药剂科、皮肤科、医学影像科、呼吸内科、临床护理
市级重点实验室：感染免疫研究室、结核病防治重点实验室
市级临床医学中心：苏州市感染性疾病学临床医学中心、苏州市呼吸系统传染性疾病临床医学中心
紧急医学救援基地：苏州市传染类紧急医学救援基地、苏州市中毒类紧急医学救援基地
市级重点实验室：苏州市感染免疫重点实验室、苏州市结核病防治重点实验室、苏州市不明病原体感染性疾病诊疗重点实验室
护理培训基地：中华护理学会结核病专科护士京外临床教学基地、江苏省传染病护理专科护士培训基地、苏州市传染病护理专科培训基地